Từ ngày 2-4-2012, mức thu lệ phí cấp giấy phép quy hoạch là 2 triệu đồng/giấy phép, thu bằng đồng Việt Nam và không phụ thuộc vào tổng mức đầu tư dự kiến của dự án. Đó là quy định mới về lệ phí cấp giấy phép quy hoạch theo thông tư số 23/2012/TT-BTC hướng dẫn chế độ thu, nộp và quản lý sử dụng lệ phí cấp giấy phép quy hoạch do Bộ Tài chính ban hành ngày 16-2-2012.

Trước đây, tại Nghị định số 37/2010/NĐ-CP ngày 07-4-2010 của Bộ Tài chính quy định lệ phí cấp giấy phép quy hoạch được xác định bằng tỷ lệ phần trăm của tổng mức đầu tư dự kiến của dự án đầu tư xây dựng. Việc thu lệ phí cấp giấy phép quy hoạch với mức chung sẽ giúp tiết kiệm thời gian cho các cá nhân, tổ chức trong việc tính toán tỷ lệ phần trăm mức phí mà mình phải nộp.

Cũng theo thông tư, lệ phí cấp giấy phép quy hoạch là khoản thu thuộc ngân sách Nhà nước. Đối tượng nộp lệ phí là các tổ chức, cá nhân được cơ quan nhà nước có thẩm quyền cấp Giấy phép quy hoạch. Các cơ quan nhà nước thuộc Uỷ ban nhân dân cấp tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương và Uỷ ban nhân dân thành phố thuộc tỉnh, thị xã, quận, huyện khi cấp giấy phép quy hoạch có nhiệm vụ tổ chức thu, nộp, quản lý và sử dụng lệ phí cấp giấy phép quy hoạch.